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Sequence alignment and annotation

一、目的要求
1. 培养学生进行序列比对的能力。
2. 掌握序列比对的目的和工具BLAST。
3. 熟悉序列比对结果解读
4. 了解序列比对的类型和序列注释内容与过程及工具。
二、主要内容
1. 序列比对概念及类型。
2. BLAST类型、原理与相关参数。
3. BLAST工具使用(课内自学)。
三、学时安排
    共3学时,含理论课1.5学时,示教0.5学时。其中“GenBank数据查询”课内自学(1学时)。 
四、教学方法
1. 多媒体PPT+示教。 
2. 课内自学:提供新冠病毒序列数据,进行BLAST序列比对摸索使用。
3. 课外自学:结合上一章学习的序列数据库查询技术,进行基于BLAST工具基础的新冠病毒信息探索,以及对其他序列注释工具的了解。提供引导性操作文档,课外分组自学,小组提供学习记录资料。
4. 总结
五、重点、难点
重点:序列比对及BLAST工具参数与使用。
难点:序列比对原理和序列注释。
六、授课语言
汉语