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本科创新智造与科研科普

本项目集主要针对在校大学生(大一、大二及大三或大四)开展的开放性创新智造与科研科普训练及研发项目,旨在为大学生提供接触、学习开源数据科学技术及基于组学大数据、知识图谱为基础的科研思维训练与实战研发项目,为高质量就业及科研深造提供潜在机会与打下良好基础。项目包括:

  • 大一新生(Debian LinuxDrupalPython训练)
  • 大二老生(文献查询与阅读、生物信息代码与生物数据库,包括Google Scholar, PubMed;Bioconductor, Rstudio、R;GEO, TCGAKEGG等工具与数据库;基于组学数据信息挖掘与标志物发现、生物数据库管理与开发,包括DrupalNeo4j、Knowledge Graph等工具)。
  • 智能POCT设备研发:利用开源硬件(Arduino、物联网协议MQTT、开源软件DrupalPythonj)等进行小型化与移动化床旁/穿戴式POCT研发。
  • 医学检验健康知识科普:利用手绘、动画、微视频及通俗易懂文案,对血常规、尿常规等医学检验知识进行文创科普创作,并形成与智能POCT健康管理APP进行内容融合。
  • ExoBCD知识库与工具研究:持续推进ExoBCD外泌体标志物发现知识库研究。主要开展:数据库结构更合理地设计、新的知识内容整合与在线分析工具开发
  • 乳腺癌外泌体组学知识图谱研究:通过知识图谱技术,开展乳腺癌外泌体组学数据与知识的科学融合,为外泌体标志物发现提供更高效、准确的手段。
  • 肿瘤精准风险分层与预后预测研究:利用多组学数据和相关方法进行肿瘤预后风险分子筛选,利用深度学习或机器学习构建风险预后标签以及患者风险分层,深度解析肿瘤生物学风险异质(如肿瘤微环境差异、缺氧环境等)。