开源技术与研究应用
开源自诞生那天起就颠覆了人们的思维，如今它已在政府部门、教育科学、工业农业、软件硬件等领域蓬勃发展。Drupal-pi，一个将开源内容管理开发框架运行于开源硬件设备上的计划。通过使用Raspberry Pi硬件平台和平台群集（Raspberry Pi Dramble，图2），最新的Drupal 8可以完美运行。
1. 开源硬件与开源软件
采用开源硬件设备（如Raspberry Pi、Onion Pi、DesignSpark、ThingSpeak、Arduino、chipKIT等）与相关通讯协议，如MQTT、BACNet、BACNet Stack（BACNet Stack协议）、ModBus（工业通讯协议）、HTTP（超文本传输协议）、SNMP（简单网络协议）、VoIP（网络语音协议）、VSCP（简单控制协议，如VSCP home automation）、EMail等，以及用户前端应用程序，如NagiOS（开源系统状态与网络信息监控系统）、Mango（Infinite自动化公司提供的支持设备间以Modbus, BACnet, SNMP, HTTP协议通讯的软件平台）、MisterHouse与Drupal等，可实现从硬件平台到软件平台以及用户端应用的整合。
而基于Drupal实现这种整合，似乎也变得越来越容易，如Terrarium_D7、Sensor-Server on Drupal、Arduino Drupal、Raspberry-Pi D7、Raspberry-pi-dramble、Farm_Sensor、BACnet for Drupal、VoIP Drupal、Drupal-mango、Nagios-Monitoring-on Drupal（监控）、FarmOS（基于EMail协议传感的农场检测与管理）等。
这之中，将Wacnet与Raspberry-Pi D7结合起来，并同时结合BACnet Router或Converter（如Modbus-to-BACnet）及数据中间插件（MiddleWare）（如数据记录<Datalogger>、数据采集<Acquisition Systems>系统[4, 5]）、用户界面控制（Annikken Andee[6]）：/— MicroService ，对于实现从Raspberry Pi硬件平台到Drupal软件平台的无缝连接是具有折腾意义的（图1）。
图1 开源硬件Arduino/Raspberry pi、开源软件Drupal与医学检验设备的整合构想
图3 Raspberry Pi Zero
图4 MK802iv miniature PC with Ubuntu Wacnet image
图5 MicroB: Plug and explore your BACnet networkas well as BACnet Data
图6 Drupal Pi
图7 Arduino与Raspberry pi的整合[5]
除此之外，Labware（https://open-labware.net）、Openhardware（http://openhardware.science）提供良好的科学研究开源硬件方面的支持，例如：
- 开源数字微流控技术Dropbot&DStat：https://microfluidics.utoronto.ca
- 开源数字微流控平台OpenDrop：http://www.gaudi.ch/OpenDrop
- 开源数字微流自动系统DropBot：https://microfluidics.utoronto.ca/dropbot/，https://sci-bots.com
- 低成本微流控开放平台：https://github.com/SynBioUC/FluoPi
- 开放纸质微流控：https://github.com/SynBioUC/Corchea-1
- 开源高精度3D打印：https://www.instructables.com/DIY-high-resolution-3D-DLP-printer-3D-printer
- 开源高精度机械定位OpenFlexure：https://openflexure.org
- 皮升容量生物样品制取装置OpenSpritzer：https://open-labware.net/projects/openspritzer
- 可3D打印开源荧光显微镜FlyPi：https://open-labware.net/projects/flypi
- 开源神经元信号装置：https://open-labware.net/projects/spikeling
- 可打印3D开源微量移液器：https://open-labware.net/projects/biropettes
利用上述开源硬件，可实现多种创新创意。例如创意站点Pinterest（https://www.pinterest.com，https://www.pinterest.com/openhwlabs）、电子创意中心（https://www.electronicshub.org）、Arduino硬件创意（https://create.arduino.cc/projecthub/projects/tags/arduino，https://www.electronicshub.org/arduino-project-ideas， https://www.hackster.io）收集罗列多种创意项目。而来自Instructable（https://www.instructables.com）则提供了相关硬件制作的
2. 开源开放科学数据
目前，国际基因表达公共数据库NCBI GEO（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo）、癌症基因图谱数据TCGA（https://portal.gdc.cancer.gov)以及Nature开放数据（https://www.nature.com/sdata）让基因组相关研究数据变得触手可及。例如，Nature开放多组学数据（https://www.nature.com/collections/hbchcddagg）提供了多个研究结果数据的访问入口（实例：lncRNAKB, a knowledgebase of tissue-specific functional annotation and trait association of long noncoding RNA）。
此外，CbioPortal for Cancer Genomics, (http://www.cbioportal.org) 、EurOPDX Data Portal (https://dataportal.europdx.eu)、Xena browser (https://xenabrowser.net)、OmicsDI (http://www.omicsdi.org)和dataMed (https://datamed.org) 和Google Dataset Search (https://datasetsearch.research.google.com)为组学数据的访问和下载提供强有力地支持。而Kaggle（https://www.kaggle.com）则让数据建模与机器学习为特色的，让数据学习和实践变得有数可依（可查看“用Kaggle开启机器学习之旅”）。
*说明：本文是“开源的思考: 从硬件到软件再到用户——移动医疗与IVD-POCT产品”的升级文本。
参考
- OpenSources. https://opensource.com
- DesignShare. http://www.rs-online.com/designspark/designshare/chn
- Smart Home Project with ThingSpeak, Arduino, chipKIT, and Drupal. http://community.thingspeak.com/2012/05/smart-home-project-with-thingspe...
- Open source data logger for low-cost environmental monitoring. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4030251
- Arduino + Raspberry Pi + Sending data to the web. http://www.benk.ca/node/10
- A demo for open hardware meeting open software: Arduino + Android + Drupal . https://insready.com/en/blog/demo-open-hardware-meeting-open-software-ar...
- Annikken Andee–Arduino与Android间的简易连接。http://www.xlgps.com/article/372505.html
- Hardware Hacks: Onion Pi, DesignSpark and Arduino control boards. http://www.h-online.com/open/news/item/Hardware-Hacks-Onion-Pi-DesignSpa...
- A BACnet Module for Drupa. http://www.function1.com/2015/04/a-bacnet-module-for-drupal
- The "BACnet Group - Drupal" is a non-profit organization (in development) to promote the use of Drupal as an energy conservation measure. http://www.bg-drupal.org
- Monitoring Drupal using Nagios integration. http://2bits.com/articles/presentation-monitoring-drupal-using-nagios-in...
- Drupal-based farmOS manages food, farmers, and community. https://opensource.com/life/15/11/farmos-drupal-based-farm-management-so...
- BACnet Group Google+. https://plus.google.com/communities/115085625631654702949/stream/4cc36de...
- Ubuntu Wacnet image. http://blog.hvac.io/2014/09/08/sd-card-ubuntu-wacnet-image
- Wacnet: https://hvac.io/docs/wacnet
- Microservices. https://www.drupal.org/project/microservices
- Drupal and the Internet of Things, https://www.orkjern.com/drupal-internet-of-things
- Drupal and IoT. Code examples, https://www.orkjern.com/drupal-iot-code-part-one & https://www.orkjern.com/drupal-iot-code-part-2
- Beyond the Blink: Add Drupal to Your IoT Playground, https://events.drupal.org/neworleans2016/sessions/beyond-blink-add-drupa...
- Simple REST calls with Arduino over WiFi, http://rexstjohn.com/simple-rest-calls-with-arduino-over-wifi
- A REST API for Arduino & the CC3000 WiFi Chip, https://learn.adafruit.com/a-rest-api-for-arduino-and-the-cc3000-wifi-ch...
- Designning electronic schematics with no previous knowledge of hardware, http://milletool.com
- Makerfire, https://makerfaire.com
